dsh-zotero-flow

dsh-zotero-flow

DeepSeek Harness（DSH Desktop）插件：连接 Zotero，在机构登录下把文献全文取回来，并连同条目一起归入指定分类。

它给 agent 装上的是一条完整流水线：

DOI/标题  →  规范元数据  →  机构登录会话里取 PDF  →  归档进 Zotero 分类

仓库： · MIT

它能做什么

工具 · 作用 zotero_status · 体检：Zotero 是否在跑、连接器 / 本地 API 状态、当前归档目标、浏览器会话与落盘目录 library_sites · 列出院内「数据资源数据库」里的各站点（知网、万方、ScienceDirect、WoS、Springer、IEEE、Wiley、T&F、ACS、SciFinder、IOP、MathSciNet、ProQuest、SpiScholar、科学文库、超星…）以及每站取全文的可行路径 literature_lookup · 用 DOI / 标题 / arXiv 号解析规范元数据（Crossref、OpenAlex、Unpaywall，免密钥），并给出开放获取 PDF 直链与出版社归属 scholar_session · 起一个独立资料目录的 Edge/Chrome，用户在其中登录学校 SSO / CARSI / WebVPN；之后打开页面并读回引文 DOI、citation_pdf_url、页面 PDF 链接、登录/付费/验证码迹象 scholar_download · 在已登录会话里抓 PDF 落盘。三条通道自动竞速：下载落盘 / Network 响应体 / 页面内 fetch；也能只监视下载目录，接管用户手动点的「下载全文」 zotero_collections · 查看当前归档目标与可选分类 zotero_save · 元数据 + PDF 一次性归档到分类（DOI/标题 + 本地或在线 PDF + 标签 + 子笔记） zotero_import_pdf · 把本地已有 PDF 归档；先从 PDF 里抠 DOI 解析元数据，抠不到就交给 Zotero 自己识别

外加一份技能（zotero-literature-flow）和一段系统提示，教模型按正确顺序用这些工具、以及什么时候该停下来问用户。

安全收紧与逐篇下载

• 优先提取当前文献的 PDF 直链，核对 DOI/PII，避免误取参考文献链接；没有直链的中文库仍由用户点击。
• 成功后仅关闭插件创建的取全文页及仍停在原地址的关联文献页。失败、验证码和用户自行打开的登录页保留；浏览器和登录资料目录不关闭、不清理。
• 浏览器已经下载的 PDF 复用原路径，不另存重复副本。saveAs 只用于从内存响应体新建文件。
• 校验 PDF 文件头、常规文件类型及 128 MiB 上限；新建文件使用独占创建，拒绝覆盖已有文件或符号链接目标。
• 参数只接受不含账号密码的 HTTP(S) URL；阻止 localhost、私网 IP 字面量和非网页协议。文档请求重定向同样检查。这不是完整 SSRF/DNS 重绑定防火墙：域名解析及浏览器子资源仍由浏览器/操作系统管理，机构 WebVPN 域名可正常使用。
• CDP 仅使用本机地址，取消任意来源通配符，验证调试端点；Zotero 只接受 loopback IP，禁止跟随 HTTP 重定向。
• 403、429 和检测到的人机校验停止自动下载及归档，不自动调用 Zotero 解析器换入口。页面检测为启发式，不能保证识别所有站点校验。
• 单控制器拒绝重叠导航/取全文操作，等待参数有明确上限。

离线回归测试

npm test

默认测试全部使用模拟 CDP、fetch 和 Zotero，不启动真实浏览器、不联网、不写真实文献库。原联网体检移到 npm run selftest:integration，需要人工明确选择；浏览器/Zotero 写入自检同样不是默认测试的一部分。

本次保留本地 1.0.1 的入口/技能注册改动，不把 host-inspect、浏览器 profile、PDF、登录记录或任何凭据纳入版本库。

安装

插件是一个标准的 DSH 组合包（package.json 里声明了 dsh.bundle.patch）。

从 GitHub 取下来

git clone https://github.com/YHzed/dsh-zotero-flow.git

从界面安装

1. 打开 DSH Desktop 的 侧栏 → 插件。
2. 点 添加插件。
3. 在输入框里填插件目录的绝对路径（或打包好的 .tgz 绝对路径），例如 clone 下来的

D:\tools\dsh-zotero-flow

1. 点 安装，装完点 立即启用。

如果插件装在了别处或你想自己打包一个 .tgz：在插件目录下跑 npm pack（无依赖，直接可用）， 把生成的 dsh-zotero-flow-1.0.0.tgz 路径填进「添加插件」即可。

装完确认：回到对话里让 agent 调一次 zotero_status，能看到 Zotero 版本和落盘目录就通了。

改了插件代码之后要重新走一遍安装（profile 里的插件是复制进去的，不感知源码更新）。

首次使用前的两件事

1. Zotero 桌面端要开着

插件走的是 Zotero 自带的连接器 HTTP 服务（127.0.0.1:23119），默认就是开的，不需要 API key。 zotero_status 会打印版本号，读到版本号即通。

自动导入前必须打开本地 API（用于强制检索与查重）： Zotero → 编辑 → 设置 → 高级 → 常规 → 勾选「允许本机其他应用与 Zotero 通信」。

• 关着：只能看到「当前选中的分类」与「最近使用过的分类」，库内条目检索不可用。
• 打开：能读到带 key 的完整分类树，并能在库内检索、查重。

Zotero 10+ 的本地 API 支持经过用户授权的写入和附件上传；旧版可能仅支持读取。虽然连接器本身可以直接新建条目，插件的自动归档入口现在强制先用本地 API 查重；给已有条目追加附件使用 Zotero 10+ 本地 API。首次写入会弹出“DSH Zotero Flow”的授权窗口；选择允许或始终允许，不要提供 zotero.org 云端 API key。

逐篇全文获取：下载 → 精确关页 → 核验 → 查重归档 → 下一篇

系统提示和技能要求：PDF 确认落盘成功后，立即按本篇精确 PII/完整 DOI 或已核对文章 URL，仅关闭本篇文章页与 PDF 页；再调用 scholar_session action=tabs，核验本篇页面全部消失，之后才用本地 pdfPath 归档、处理下一篇。关页失败或核验未通过时暂停，保留本地 PDF，不重复下载。

保留浏览器窗口、空白页、扩展、机构登录及待人工处理的验证页；禁止按域名泛关或无参数全清。下载失败/超时/验证页不走下载成功的清理分支。已有本地 PDF 且没有对应打开页面的导入不需要此关页步骤。

实现边界：以上完整顺序是 agent 执行规则，并非浏览器代码的跨工具强制状态机。当前下载代码只尝试关闭抓取标签页，没有实现按 PII/DOI 清理所有本篇标签页并核验的自动门禁；需使用环境中已验证的精确关页能力，或由用户手工关闭后核验。下面的导入查重与追加附件则是代码强制执行。

自动导入：先查重，再补附件，最后才新建

zotero_save 与 zotero_import_pdf 默认执行这一规则，而不是依赖模型记得先调用搜索：

• 先检查库内已有书目和相同 PDF 文件哈希。唯一可靠身份匹配时复用原条目，只追加缺失的 PDF，保留原分类和元数据。
• 相同 PDF 已存在时跳过；已存在书目但文件不同则添加为新的子附件。
• 确认书目与相同文件都未命中时，才新建条目并添加 PDF。
• 多个候选、身份冲突、检索不完整或本地 API 不可用时停止，不能以检索失败为由直接新建。需要人工确认时使用下面的显式追加工具。
• 上传失败后保留并报告已有条目/不完整附件信息；失败不会自动降级为新建书目。

给已有条目追加 PDF（不重复建书目）

1. zotero_search query="标题或 DOI"，核对返回的 key，多个候选时先确认。
2. zotero_attach_pdf itemKey="真实的8位key" pdfPath="本地PDF绝对路径"。
3. 在 Zotero 中批准应用写入授权。工具创建 PDF 子附件，保留父条目与原分类；相同 MD5 的文件会跳过。此接口不新建父条目，也不会下载 PDF。
4. 如果上传中断，返回 attached:false 与已创建附件 key；应检查该不完整子附件后恢复，不要盲目重复创建。授权凭据仅在内存中保存，不写入日志或文件。

2. 先登录一次机构账号

第一次需要取全文时，agent 会调 scholar_session action=start，弹出一个独立的浏览器窗口 （资料目录默认 %USERPROFILE%.dsh-zotero-flow\edge-profile，和你日常用的浏览器互不干扰）。

在这个窗口里完成学校登录（图书馆统一身份认证 / CARSI / WebVPN），登录状态会长期保留，之后每次取全文都复用它。

如果你的学校需要走 WebVPN 或 EZproxy 前缀，把前缀填进插件配置的 institutionProxy，例如：

institutionProxy: https://webvpn.example.edu.cn/http/

和人配合的几条规矩

这个插件不是全自动爬虫。有三件事按规矩来：

人机校验交给用户。 页面出现验证码、滑块、点选或 Cloudflare 验证时，agent 会停下手上的步骤， 请你在机构浏览器窗口里手工过一次，等你回话再继续 —— 它不会自动识别验证码，也不会注入脚本伪装成人类。

机构登录只提醒一次，之后复用。 某个平台第一次需要机构登录时，agent 会提醒你在机构浏览器窗口登录 你的学校（SSO / CARSI / WebVPN）；之后同一个平台再取全文，它默认你已经登录好，先核实会话状态就直接继续， 不会反复打断你。机构和平台的登录情况记在 %USERPROFILE%.dsh-zotero-flow\institution-login-record.md （只记状态：机构、方式、入口、各平台是否已登录；不记密码、验证码、cookie 值或令牌）。 每次取全文前 agent 先读这份记录，判断「这个平台是已经登录好的，还是该提醒用户登录」。

不做反检测规避。 站点起疑时（403 / 429 / 验证页）正确反应是放慢节奏、交给用户、如实说明， 而不是想办法骗过检测：不注入脚本改写 navigator.webdriver 或指纹、不伪造 UA、不用打码服务、不伪造登录态。 一次只处理一篇，不做批量抓取。真实浏览器 + 你的真实登录态 + 人工过验证，这三样就够了。

典型用法

对 agent 说：

帮我下 10.1038/nature12373 这篇，存到 Zotero 的「纳米测温」分类

agent 会：zotero_status 体检 → literature_lookup 拿元数据 → scholar_session 打开 DOI 落地页 → scholar_download 抓 PDF → zotero_save 归档。

中文库这类只能人工点击的：

从知网找「高熵合金 金属陶瓷」那篇，下载后存进 Zotero

agent 会打开知网检索页并把下载这一步交给你：你在弹出的窗口里点「下载全文」， 然后 agent 用 scholar_download（不传 url）接管下载目录里新出现的 PDF，再 zotero_import_pdf 归档。

配置

在 profile 的 cordis.patch.yml 里覆写（用户层补丁会在插件层之后生效）：

- id: dsh-zotero-flow
  name: 'dsh-zotero-flow'
  config:
    zoteroPort: 23119        # Zotero 本地 HTTP 服务端口
    mailto: you@example.edu  # Crossref / Unpaywall 的「礼貌池」邮箱，建议填
    browserPath: ''          # 留空自动探测 Edge / Chrome
    browserProfileDir: ''    # 机构登录用的资料目录
    cdpPort: 9333            # 浏览器调试端口
    downloadDir: ''          # PDF 落盘目录
    institutionProxy: ''     # WebVPN / EZproxy 前缀
    proxyUrl: ''             # 插件自身 HTTP 抓取的出口代理（不影响浏览器）

站点清单在 lib/catalog.js 的 LIBRARY_SITES：里面是各校图书馆资源页上通用的主流库， 要补自己机构独有的入口（校内门户、专业库），照该数组里现有对象的形状往末尾加一条即可 （pdf 取 'direct' | 'meta-pdf' | 'manual' | 'mixed'，JS 渲染的站点标 stableSearch: false）。

已知边界（重要，别踩）

① Zotero 连接器只能归档到「当前选中的分类」或「最近使用过的分类」。 这是 Zotero 自身的设计（SaveSession.update 通过 zp.collectionsView.selectByID() 切换目标）。 所以要让文献进某个分类，正确做法是先在 Zotero 左侧点选那个分类，再让 agent 归档。 zotero_collections action=targets 会列出当前可选的目标 id（L1 / C12 这类）。 本地 API 里的分类 key 不是连接器的目标 id，两者不能混用。

副作用提醒：归档时插件会调 updateSession 把目标分类落到条目上，Zotero 界面里选中的分类会跟着切过去。

这是 Zotero 连接器协议本身的行为，不是插件在乱动你的界面。

② 全文权限来自用户的机构会话，不来自插件的 HTTP 请求。 从 Node 进程直接 fetch 出版社页面通常只会拿到付费墙或登录页。要全文就必须走浏览器会话。

③ 附件必须带一个非空的来源 URL。 Zotero 的 Zotero.Attachments.importFromNetworkStream 在 url 为空 / 缺失 / null 时直接抛异常， 服务端只回一个光秃秃的 500（SAVE_ATTACHMENT 失败时看不到原因）。 插件已经处理：抓取来源 → DOI 落地页 → 兜底值，依次取第一个非空。

④ 中文库基本没有可自动下载的 PDF 直链。 知网、万方、ProQuest 学位论文、科学文库、读秀都是 JS 应用，PDF 往往分章节或走专门阅读器。 插件不硬碰，改为「打开页面 → 用户点击 → 接管下载目录」。

⑤ 浏览器会被设成「PDF 一律下载」。 这是必需的：Chromium 默认用内建阅读器显示 PDF，此时响应体既不进网络栈也落不了盘， CDP 根本拿不到字节。插件在自己的资料目录里把 plugins.always_open_pdf_externally 设为 true， PDF 直接进 downloadDir —— 既拿到字节，用户也顺手得到文件。这个设置只影响插件自己的资料目录。

⑥ 已有条目补附件需要 Zotero 10+ 本地 API 与原生写入授权。 连接器的 saveAttachment 仅适用于同次会话新建条目；已有条目通过本地 API 追加附件。自动导入先查重，复用已有父条目并保留分类，确认不存在才新建。当前自动查重仅支持个人文库；群组目标会停止，避免跨库误匹配。

⑦ 不做反检测规避，也不自动过验证。 站点起疑（403 / 429 / 验证页）时，插件与 agent 的动作是停下、放慢、把页面交回给你； 不去想办法骗过检测：不注入脚本改写 navigator.webdriver 或指纹、不伪造 UA、不用打码服务、不伪造登录态。 保持「真实浏览器 + 你的真实登录态 + 人工过验证」这三样，就够用了。

排错

现象 · 原因 / 处理 Zotero 未响应 · Zotero 桌面端没开，或端口被改过（同步改 zoteroPort） 本地 API 未开启 · 自动导入会停止，以免无法查重而重复建条目；按上文开启后重试 Zotero 挂载 PDF 失败（HTTP 500） · 见「已知边界 ③」，通常是来源 URL 为空 浏览器起不来 · 未装 Edge/Chrome，或 cdpPort 被占用；用 browserPath 显式指定 抓不到 PDF · 页面需要登录 / 有人机校验 / 无订阅权限；scholar_session 的返回里会带「页面迹象」 页面出现人机校验 · 由你在机构浏览器窗口里手工过一次；agent 不刷新重试、不换入口试探、不自动过验证 某平台提示需要登录 · 先看机构登录记录：没登录过就提醒你登录；记录里已登录却仍停在登录页，说明会话失效，重新登录后更新记录 归档到了错的分类 · zotero_collections action=targets 看可选目标，在 Zotero 里点选正确分类后重试

测试入口（默认 npm test 只运行离线模拟回归，不连接真实 Zotero、不写库）：

node scripts/test-tools.mjs          # 只读：加载插件、跑不写库的工具
node scripts/selftest-browser.mjs    # 浏览器会话 + CDP PDF 抓取（本地起服务，不依赖外网）
npm test                            # 默认离线安全、附件和导入回归测试
node scripts/session.mjs status      # 手动驱动机构登录会话（同 lib/browser.js）

旧 selftest:zotero 已禁用：其真实 DOI 测试可能向已有真实文献追加合成 PDF。真实写入验证应仅在隔离的 Zotero 测试资料目录中、明确选定测试条目和文件后执行。selftest:integration 是显式只读集成测试，依赖运行中的 Zotero 与外部元数据服务。

结构

index.js                 插件入口：注册工具 / 技能 / 系统提示
lib/define-tool.js       本地 defineTool（schema DSL → JSON Schema），不依赖宿主包
lib/catalog.js           数据资源站点目录、DOI 前缀 → 出版社映射
lib/zotero.js            Zotero 客户端（连接器 + 本地 API 检索和授权写入）
lib/metadata.js          Crossref / OpenAlex / Unpaywall / PDF 内 DOI 抽取
lib/browser.js           Edge CDP 会话、页面分析、三通道 PDF 抓取
lib/tools.js             工具定义、查重和归档主流程
client/client.js         浏览器端 Toolview（含数据库网格卡片）
skills/literature-flow/  技能正文

许可

MIT